Stetoskopa dezinfekcijas biežums ir atkarīgs no lietošanas scenārija un vides:
Parastajās ambulatorajās nodaļās, ja stetoskops tiek izmantots tikai vispārējiem pacientiem un nav acīmredzama piesārņojuma, ieteicams to dezinficēt 1-2 reizes nedēļā.
Departamentos, piemēram, pediatrijas un elpošanas departamentos, kas ir viegli pakļauti infekcijas patogēniem, vai īpašās zonās, piemēram, infekcijas slimību nodaļās un intensīvās terapijas nodaļās, pēc katras lietošanas reizes jāveic dezinfekcija.
Ja stetoskopu īsā laika periodā izmanto vairāki dažādi pacienti, vislabāk to dezinficēt pēc katras lietošanas reizes, pat ja intervāls ir īss.